知识创新工程试点工作方案

当前，经济全球化进程的加速使我国社会与经济的发展对科技进步提出了更为紧迫的需求。随着人类基因组测序的完成和人类脑计划的推进，生命科学正在进入"后基因组时代"和"脑科学时代"。生命科学将从整个基因组及其编码的全套蛋白质结构-功能相互关系的高度去了解生命活动的全貌，整合有关生物学的基础知识，揭示生命活动的规律和本质。生命科学的发展将对人类健康和社会进步产生重大影响。生物物理所将努力通过实施知识创新工程，为我国生命科学的发展做出基础性、战略性、前瞻性贡献，朝着国际一流科研机构的目标迈进。

一、试点工作总目标及阶段考核目标

    生物物理所试点工作的总目标是：针对后基因组时代生命科学领域的重大问题，重点开展结构基因组学和脑与认知科学的研究，为解决关系人类健康的重大问题提供新的理论和方法；建立一支以在国内外有较高学术地位和影响力的科学家为核心，以青年学术带头人为骨干，年龄、知识结构合理，具有国际竞争力的科技队伍；培育倡导科学精神和创新进取的价值观，建立与国际接轨的现代研究所制度和行为规范体系，建成发达国家中等水平的园区环境和科研条件，形成适合基础科学研究的创新文化。通过10年左右的努力，使生物物理所发展成为世界著名的高水平研究机构，并争取进入我院3～5 个国际一流研究所的行列，成为国家生命科学基础研究和高级人才培养的基地。

    为实现研究所的长远发展目标，在知识创新工程全面推进阶段，通过实施知识创新工程，5年内实现以下目标：

（一）科研水平与"三性"贡献目标

    在知识创新工程全面推进阶段，针对后基因组时代关系人类健康的生物学基础性、战略性、前瞻性重大问题，开展多层次多方位的基础研究。通过5年努力，结构基因组学和脑与认知科学研究达到世界先进水平，产出一批有重要国际影响的研究成果，有2～３项科技成果获得国家级奖励，力争在生物信息学和认知科学等领域取得重大突破。SCI 收录国际论文数及论文被引用数保持在全国生物学研究机构的领先地位，其中70%的论文发表在本领域高影响因子的刊物上，争取在《Nature》和《Science》上发表数篇论文。整体实力和国际影响力显著提高，申请专利50项，争取有10项授权专利，院拨经费与争取院外经费的比例达到7:3，举办3～5次在本领域有较大影响的国际学术会议。成为我国最重要的生命科学创新基地之一。

（二）人才及队伍建设目标

    建立一支以在国内外有较高学术地位和影响力的科学家为核心，以青年学术带头人为骨干，年龄、知识结构合理，具有国际竞争力的科技队伍。

    这支队伍由176名岗位聘任人员和230名流动人员组成。岗位聘任人员中科研人员148名，其中高级研究人员 118 名，包括研究员47名；管理人员15名；技术支撑人员13名。5年内从国际高水平研究机构引进优秀青年人才15～20名。岗位聘任人员中60%以上为45岁以下的青年人，60%以上具有博士或硕士学位。

    建立以博士生为主的高水平流动人员队伍。流动人员中在学博士生100名，在学硕士生100名，在站博士后、高级客座研究员及访问学者30名。研究生培养质量整体上达到或接近国际先进水平。使我所成为交叉学科高级科技人才的培养基地，不断向社会输送生命科学高级专业人才。

（三）体制与机制改革目标

    根据知识创新工程的总体要求，充分汲取发达国家的成功经验，尊重国情、院情和所情，顺应当前生物科技发展的趋势，探索生命科学基础研究所的发展道路，建立符合知识创新工程要求的现代研究所组织体制和运行机制。

    整合全所研究力量，组建"结构基因组学研究中心"和"脑与认知科学研究中心"。大力加强院内外的科技合作，与中国科学院研究生院共建院认知科学开放实验室；与理论物理所、遗传发育所等单位合作建立院生物信息学研究中心；与第二军医大学和中国科技大学等单位合作开展结构基因组学研究；与北京大学医学部开展学术交流和项目合作，互聘教授、共同培养研究生；积极开拓国际学术交流与合作的新领域、新渠道。形成以两个研究中心为基础，与国内外学术界有着广泛交流与合作，精干、高效、高水平的基础研究新格局。

    将目前的6个职能部门进一步精减为所办公室、人事教育处、科技处、财务处4个部门。完成所办公司、研发中心现代企业制度改造，建成研究所控股或参股的现代高新技术企业。科研后勤实体改制为股份制物业公司，实现后勤服务社会化、专业化、企业化。

    健全全员岗位聘任制、科研岗位最高年限制、研究和管理服务人员绩效考评制、年薪制、管理领导岗位公示制等新制度，探索研究所理事会制度。实行进人用人、考核分配和人员流动新机制，确保科技创新成为研究所的核心工作，确保科学家在研究所的中心地位。

（四）园区改造与创新文化建设目标

    在已有的良好文化传统基础上，深化体制改革、优化科研环境、营造创新氛围，建设符合知识创新工程要求的研究所文化。

    以研究所章程为核心，健全与发达国家接轨的现代研究所制度和行为规范体系。将生物物理所建成既实现法制化规范管理，又充满创新活力的现代研究所。

    倡导科学精神和创新进取。使"三严"（严肃的科学态度、严谨的科学实验、严格的科学分析）、"三宽"（宽容、宽松、宽厚）成为每个科技人员的行为准则，"唯实、求真、协力、创新"在所内蔚然成风，竞争与创新成为科技人员的价值取向。

    在已有静谧优美的科技园区基础上，通过更新改造，使我所具备智能化的楼宇建筑、功能完善的基础设施、信息畅通的网络系统，园区环境和科研条件达到发达国家的中等以上水平。

二、学科布局、组织结构调整和队伍建设

（一）定位

    生物物理所是我国生命科学的基础研究所。根据当代生命科学世界前沿领域的发展态势和国家长远战略需求，我所将瞄准21世纪生命科学研究的基础性、前沿性重大理论问题，联系与人类健康相关的重大需求，发挥多学科交叉综合的优势与特色，集中在结构基因组学和脑与认知科学的关键领域开展原创性研究，攀登生命科学研究的高峰。

（二）科研机构设置与学科布局

1．科研机构设置

    为推进多学科交叉研究，提高研究所的综合实力，在知识创新工程试点工作中，我所将重新整合全所研究力量，组建"结构基因组学研究中心"和"脑与认知科学研究中心"。研究中心拥有研究所赋予的人权、财权，负责组织实施重大研究项目，开拓新兴研究领域。

（1）结构基因组学研究中心

    结构基因组学是一个新兴的多学科综合性极强的边缘领域，为适应学科前沿发展的需求，我所将组建结构基因组学研究中心。

    结构基因组学以蛋白质三维精细结构为基础，在基因组全源信息指导下，研究与重要生命活动相关的蛋白质及其复合物、组装体的结构及其与功能的关系，探索蛋白质折叠的规律，发展生物信息学新理论新方法，为解决关系人类健康与疾病的关键问题提供新的理论依据。

结构基因组学研究中心以"生物大分子国家重点实验室"为核心，吸纳全所从事蛋白质化学、分子遗传学、生物信息学、X射线晶体学、核磁共振波谱学、电子晶体学等多方面专业队伍，通过组织重大研究项目，促进不同学科的交叉与融合，推动高水平研究团队的形成。

（2）脑与认知科学研究中心

    脑是最高级最复杂的信息处理系统，脑的许多重要功能都与感知觉信息加工紧密相关，只有多学科交叉，多种技术手段并用，才能最终了解脑信息处理的生物学机制。为此，我所将组建脑与认知科学研究中心。

    脑与认知科学以感知觉的神经基础为主要研究方向，在行为、细胞及分子层次上，研究感知觉信息的基本表达、感知觉信息加工的神经基础以及感知觉信息加工的分子基础，为认识脑、保护脑、创造脑奠定科学基础。

    脑与认知科学研究中心以"院视觉信息加工开放实验室"和"院认知科学开放实验室"为基础，吸纳国内外本领域优秀科学家来中心工作或合作研究。

2．主要研究方向

    生物物理所的学科领域包括结构生物学、神经生物学、认知科学、生物信息学、细胞与分子生物物理学，以及生物技术。根据后基因组时代生物学的前沿以及相关的国家发展需求，我所将把主要研究方向凝聚在结构基因组学和脑与认知科学两个方面。

（1）结构基因组学研究

    在基因组的全源信息指导下，研究蛋白质系列、群体和体系的结构与功能，揭示重要生命活动的本质规律，为人类健康与疾病中相关问题的解决提供新理论新途径。重点包括三个研究领域：

    领域一：蛋白质折叠规律的研究

    蛋白质折叠的机理是至今尚未解决的分子生物学最基本的科学问题，它的突破将对生物技术（特别是蛋白质工程）的发展和一些疑难病症（如疯牛病、老年性痴呆）的防治产生重大推动作用。主要从理论上研究蛋白质的氨基酸序列如何决定其三维空间结构；从实验上研究变性蛋白如何重新折叠恢复其天然构象，特别是新生肽链如何折叠成为功能蛋白质分子的过程。在此基础上，探索蛋白质一维线性序列与三维空间结构之间的确定关系，为阐明遗传信息的完整表达做出贡献。主要研究内容包括：

    蛋白质及新生肽链折叠 重点研究蛋白质折叠的中间状态，进而了解蛋白质折叠的全过程；模拟新生肽链的折叠，研究蛋白质初始结构的形成；研究折叠酶帮助蛋白质折叠的分子机理。

    蛋白质聚集规律及其结构相关疑难病症发生的分子机理 集中研究蛋白质错误折叠和发生聚集的结构因素和环境因素，聚集过程中的特异识别现象，聚集过程的动力学和分子机制，以及减少聚集的原理和方法。以朊病毒的同源蛋白为模型，研究可传染蛋白质的结构、稳定性和折叠机理；以老年性痴呆和帕金森氏病为模型，研究神经变性疾病发生和发展的分子结构基础。

    领域二：重要生命活动相关蛋白质的结构与功能研究

    研究与重要生命活动相关的蛋白质及其复合物、组装体的精细三维结构，及其与在亚细胞、细胞层次上表现出来的生命活动的关系，重点选取如下四个方面开展研究：

    造血细胞增殖和分化相关的结构基因组研究 研究与造血细胞增殖和分化相关蛋白质群体的结构与功能。重点开展人CD34+造血干细胞/祖细胞及其他血液病相关细胞的结构基因组研究，并与功能基因组研究相结合，揭示相关血液病的分子机理。

    与细胞凋亡相关蛋白的结构与功能研究 重点研究活性氧和抗氧化剂对细胞凋亡相关基因、蛋白质表达和信号转导的调控，以及DNA损伤与细胞凋亡的关系；细胞色素c及有关蛋白质因子从线粒体释放的机制，以及它们与caspase的相互作用。

    重要水溶性蛋白的结构与功能研究 综合运用X射线晶体结构分析、核磁共振波谱溶液结构解析、电子晶体学方法，研究视觉神经发育、离子通道作用、先天性和获得性免疫及其他基本生命活动中重要水溶性蛋白的三维结构及其与功能的关系，揭示相关生命活动中的分子机理。

    重要膜蛋白的结构与功能研究 把膜蛋白的功能研究与结构尤其是三维结构研究紧密联系起来，一方面选择与信号跨膜转导、蛋白质跨膜运送相关的重要膜蛋白为对象，深入研究膜蛋白介导信号跨膜的分子机理、蛋白质跨膜运送的调节机理及其结构基础；另一方面深入开展与高等植物光吸收系统和反应中心系统相关的膜蛋白的结晶和晶体结构研究，从三维结构水平揭示光合作用的分子机制。

    领域三：生物信息学新理论、新方法研究

    随着人类基因组研究的发展和深入，生物信息学已发展成一门集生物学、数学、物理学、化学、信息和系统科学、计算机科学于一体的最具活力的交叉学科。结合我所现有的工作基础及该领域的发展趋势，将重点在以下几方面开展研究：

    蛋白质结构预测新方法研究 着重研究提高结构预测的准确率的新方法，同时发展相应的计算机软件，紧密联系在结构基因组学中的应用，开展蛋白质折叠类型预测、蛋白质高级结构及功能预测和细胞内定位预测。

    比较基因组学的研究 综合利用目前已经阐明的近百个物种的基因组提供的庞大信息源，研究生命的起源和进化。

    非编码区的信息结构分析 研究占人类基因组97%的未知功能区域，揭示非编码区的信息结构。

（2）脑与认知科学研究

    以神经信息学为中心，从行为、细胞及分子三个层次开展认知、视听觉、学习与记忆等脑功能的研究，为认识脑、保护脑、创造脑奠定科学基础。

    领域一：感知觉信息的基本表达

    感知觉信息基本表达的认知科学实验研究 开展有关知觉组织的实验研究，为由大范围性质到局部性质的"不变性知觉理论"的准确科学描述提供实验证据。

    智力模块性的脑认知成象研究 用"不变性知觉理论"指导脑认知成象实验，研究视皮层通路的模块性，为系统地发展知觉信息表达理论提供基本的生物学约束，探索认知科学中的"智力的模块性" 的新模型。

    高时空分辨率的脑认知成象方法的研究 研究脑电和功能磁共振相结合的技术，形成既具有毫米级高空间分辨率又具有毫秒级高时间分辨率的脑成象系统，在无创伤条件下，观察大脑的认知活动。

    领域二：感知觉信息加工的神经基础

    大脑皮层感觉区的功能组织 研究视觉的图形、颜色、运动等参数，听觉的声音强度、频率、方向等参数在特定皮层区内的表征和整合，了解各个特化功能区域如何被组织起来以形成感觉。

    视听觉中注意的神经机制 利用有敏锐的视或听觉和目标识别能力的动物模型，同时提供生命攸关的两种目标，寻找"胜者为王"的神经网络，探索脑对视、听信号空间-时间加工的机理，揭示有关注意的基本神经机制。

    感知觉信息加工的模型和模拟 从脑高级功能的"整合"性出发，探讨与感知、学习、记忆、注意、认知、抉择和归纳等相关的神经动力学，结合神经科学实验与建模和仿真，探索神经复杂性与意识之间的关系，为人工智能、模式识别以及信息产业提供新的科学知识。

    领域三：感知觉信息加工的分子基础

    联想学习中脑对感知觉信息归纳的分子机制 用分子遗传学手段，筛选在果蝇脑内特异表达的基因突变体，揭示基因在脑中的时空表达模式。

    感知觉系统发育基因 研究脑发育过程中基因时空表达模式，探索相关遗传性眼病的致病基因，了解各种影响眼睛发育的环境因素。

3．主要学术带头人情况

    目前已聘任44名学术带头人（研究组长），其中包括院士5人，博士生导师26人，百人计划3人，杰出青年基金获得者2人。学术带头人中，45以下的青年学术带头人14人，占总数的32%。

    在知识创新工程试点工作中，将严格遵照院岗位及年龄控制指标，根据绩效优先的原则组建创新队伍。设置研究员岗位47个左右，首批岗位聘任的学术带头人30名左右,平均年龄45岁以下，具有博士学位的占60%以上。试点期间还将引进15～20名优秀青年学术带头人。

4．岗位聘任的研究人员情况

    根据院知识创新工程岗位聘任人员总量控制的规定，岗位聘任的研究人员148名，其中高级研究人员 118 人（占研究人员的80%），包括研究员 47 人（占高级研究人员的40%）。首批聘任的研究人员约100名，占岗位总数的67%，其中学术带头人30名左右，其他专业技术人员70名左右。研究人员岗位预留1/3以上，面向国内外公开招聘优秀青年人才。

（三）从事科研工作的人数、学历及年龄结构

    试点工作期间，岗位聘任人员总数逐步达到176人（1998年底在职职工488人的1/3为163名，另加8%的支撑人员13名），其中研究人员148人，管理人员15人（包括按岗位聘任人员7%核定的管理人员12名和按流动人员2%核定的教育管理人员3名），支撑人员13人（表１）。

表1 岗位聘任人员情况

（四）技术支撑服务机构的设置及岗位聘任人员情况

    技术支撑机构包括图书信息室、期刊编辑部、学会办公室、分析测试中心，知识创新工程试点工作中设置岗位13个。图书信息室目前承担我所图书、网络管理服务工作，已与院图书馆合作建立了北郊图书信息服务部，将发展成为面向北郊科技园区服务的图书信息中心，岗位聘任人员5名。期刊编辑部承担我所《生物物理学报》和《生物化学与生物物理进展》等刊物编辑、出版工作，岗位聘任人员4名。学会办公室承担挂靠我所的中国生物物理学会和中国生物化学与分子生物学会日常管理工作，岗位聘任人员2名。分析测试中心承担我所大型仪器管理服务工作，并面向社会开展分析测试服务，岗位聘任人员2名（表１）。

    特别申请按科技、管理人员的10%核定技术支撑人员岗位数。实验科学基础研究需要大型仪器设备系统支撑，研究所已经购置了600兆赫核磁谱仪等一批大型仪器，知识创新工程试点中，还将购置核磁共振脑成像系统等大型仪器。研究所依托这些装备已经成立了分析测试中心，并通过了国家计量认证，为社会提供分析测试服务，将成为北郊科技园区的技术支撑平台。运行、维护仪器装备系统，需要建立有一定规模、高素质的技术支撑队伍。另外，研究所在图书信息室的基础上，已经与中国科学院文献情报中心合作建立了北郊服务部，根据院的园区规划将发展成为北郊科技园区图书信息中心。

（五）流动人员情况

    流动人员将发展到230名，其中博士研究生100名，硕士研究生100名，博士后、访问学者和客座研究人员30名。岗位聘任人员与流动人员比例将为1∶1.29。（详见表2）。

表2 流动人员情况

三、管理体制与机制改革

    1999年以来，本届班子本着"凡是能做的事情先做起来，积极创造条件，主动迎接知识创新工程"的指导思想，根据我院知识创新工程的总体要求，以建立与发达国家高水平研究机构接轨的现代研究所体制为目标，制订了结构性调整实施方案--《全员聘用合同制实施意见》（附件1），实施并基本完成了管理体制与机制改革。

（一）管理体制改革方案

    管理体制与机制改革的任务是：整合科研、管理和支撑机构，剥离研发中心、所办公司、后勤实体，完成结构性调整。基础研究实行现代研究所制度，所办公司实行现代企业制度，科研后勤实现社会化、专业化、企业化，实现运行机制转变。建立符合知识创新工程要求的现代研究所体制。

    根据结构性调整改革实施方案，1999年以来，积极推进了管理体制改革，已经完成了部分改革任务。包括：基础研究室由6个整合为生物大分子国家重点实验室、院视觉信息加工开放实验室和分子与细胞生物物理学研究室3个基础研究室。撤销了生物物理技术研究室，组建了生命科学应用研究与发展中心。职能部门由9个调整合并为所办公室、党群办公室、科研处、开发处、人事教育处、财务处6个部门。调整了图书信息室、期刊编辑部、学会办公室等支撑机构。全面展开了所办高技术企业改制和后勤服务实体企业化、社会化改造，并取得了实质性进展。全面审核了研究所现行的制度，根据知识创新工程要求制订了一批新制度，编制了研究所制度汇编，探索性、开创性地制订了研究所章程，初步建立了现代研究所制度体系。在京区率先实行全员聘用合同制，实行了《全员聘用合同制实施意见》等14项新制度，实现了管理机制的转变。目前，实行的管理体制与发达国家研究所基本接轨，建立了现代研究所体制的雏形：三级管理、两级聘用、组为基础。

    在知识创新工程试点工作中，将进一步深化管理体制改革。根据科技目标以及研究方向和学科布局进一步整合基础研究室，组建结构基因组学研究中心和脑与认知科学研究中心。进一步精减管理机构为所办公室、人事教育处、科技处、财务处4个部门。研发中心改制为有限责任公司。完成所办公司现代企业制度改造，科研后勤实体改制为科研物业有限责任公司。进一步健全完善以研究所章程为核心的制度体系，并适时探索理事会制度等现代研究所管理制度。

（二）人事制度改革方案

    人事制度改革的任务是：健全与国际接轨的人事管理新机制，建设精干、高水平的创新队伍。

    1．建立进人用人新机制 制订并实施了《全员聘用合同制实施意见》，以及《科研岗位最高年限制度》、《管理领导岗位公示制度》、《年薪制实施办法》、《基础研究人员考核办法》、《机关部门工作人员工作绩效考核办法》等配套制度，建立了与国际接轨的用人新机制。实行了按需设岗、公开招聘、竞争上岗、签约管理和分级聘用、分层管理的机制。做到了人员能进能出,岗位能上能下，待遇能高能低。实施聘用合同制奠定了研究所人事管理的法律基础，为社会保险制度建立后真正形成人员合理、有序流动，彻底搞活人事管理机制创造了条件。

    2．建立考核新机制 研究组长实行聘期届满考核和最高年限制；机关人员实行年终上级、同级、下级以及服务对象多方位的考评，根据考评结果决定岗位去留、职务上下和待遇高低。知识创新工程试点中，将通过国内外同行评议，对研究组长实行竞争上岗、聘期考核、择优续聘的最高年限制(Tenure Track)。

    3．建立分配新机制 根据院建立"三元"结构分配模式的政策，结合不同性质的工作，建立了年薪制。随着人才队伍素质的提高，将目前施行的绩效年薪制过渡到岗位年薪制。

    4．建立以培养博士研究生为主的研究生教育管理体制 建立招生、教育和学位授予全过程质量保障制度，使研究生培养质量整体上达到或接近国际先进水平。

    5．采取有效政策和措施，积极引导人员分流 为保证高起点实施知识创新工程，1999年以来，通过实施全员聘用合同制，稳妥地组织了人员分流。在知识创新工程试点工作中，争取5年内完成未进入创新试点序列人员的分流安置。主要措施是：所控股参股公司分流安置80人左右。后勤物业有限责任公司分流安置30人左右；有项目和经费的研究人员，聘任为项目负责人，今后取得显著绩效者可以进入创新试点序列，以此分流安置30人左右；5年内有60余人将达到退休年龄；其余人员根据院的规定离岗安置或通过向社会流动而分流。

（三）科研后勤改革方案

    试点阶段科研后勤体制改革的任务是：建立符合科研后勤自身发展规律的组织体制，实现后勤管理社会化、专业化、企业化，为科技创新提供优质、高效、低成本的服务，营造优良科研环境。主要措施是：建立后勤项目管理制度，理顺后勤管理职能。将现有后勤实体整合改制为股份制物业公司。科研后勤项目面向所办物业公司和社会企业公开招标，所办物业公司通过竞争取得后勤服务项目。

    已经制定了科研后勤体制改革配套方案（附件2：《科研后勤体制改革实施意见》），将于2001年上半年全面启动实施，2002年内建立所办后勤物业公司，2003年末后勤管理新体制和新机制实现正常运行。

（四）所办企业改制进展情况

    试点阶段所办公司改革的任务是：将所办公司改制为研究所控股或参股的高新技术企业，公司依照现代企业制度运作，研究所以股权享受所有者的权益。其中：研究所以中生公司的净资产投入，与北控高科等五家企业共同发起组建中生北控生物科技股份有限公司，该公司已于2001年4月正式设立。百奥公司拟变更为股份有限公司。科龙公司改制为有限责任公司，现已完成资产评估工作，正在进行评估结果的确认。研究所以伽玛中心的净资产出资，公司职工以现金出资，改制为有限责任公司。目前，伽玛中心已完成资产评估及确认工作，正在进行设立有限责任公司的报批准备工作。所办公司将于2001年底前全部完成改制工作。所办企业改制进展情况见附件3：《所办企业改制方案及进展》。